Lograr una protección real de la biodiversidad nacional y una efectiva implementación del derecho ambiental en Colombia presenta bastantes obstáculos. Muchos de estos problemas tienen, paradójicamente su origen en iniciativas políticas y económicas de los gobiernos de las últimas décadas. Por otro lado, factores como el conflicto armado interno, la corrupción social e institucional, o presiones económicas internacionales son los elementos que mas inciden en la explotación indiscriminada de recursos naturales los cuales no respetan las condiciones sociales y ambientales tanto de las poblaciones vulnerables como las de los ecosistemas.